Ich habe solche sich überlagernden Objekte bestehend aus Flächen und Konturen:

 

Am Ende brauche ich alles sauber getrennt als verbundene Flächen (nur blau und nur weiß) ohne die im Bild noch sichtbaren Überlagerungen. Normalerweise würde ich jetzt die Kurven in Flächen wandeln und dann mit dem Pathfinder das vordere Objekt aus den hinteren ausstanzen und dann die gewünschten Teile wieder verbinden. Allerdings gibt es bei diesem Projekt hunderte solcher Objekte und ein Objekte kann dutzende andere überlagern. Manuell jedes Objekt gegen jedes andere ausstanzen würde da vollkommen den Rahmen sprengen. 
Gibt es da elegantere Lösungen? Also die automatisierte Umwandlung des Sichtbaren in Flächen? Quasi so wie es bei der Bildnachzeichnung von Pixelvorlagen gemacht wird, nur hier direkt von der Vektorvorlage? 

Ich glaub, das selbe Problem hatte ich kürzlich:

 

Hab die dort verlinkte Methode von @Vektorgarten benutzt und es funktioniert auf Anhieb und tadellos.