Ich kapier grad nicht mehr, wie "Pfad verschieben" funktioniert. 

Links ein gefüllter Kreis, dessen Pfad negativ verschoben werden, also verkleinert werden soll.
Rechts das Ergebnis von "Pfad verschieben".

Warum wird aus gefüllten Kreis ein identisch großer Kreis mit Outline?

Wie bekomme ich den Kreis über "Pfad verschieben" verkleinert?

Ich habe – ganz unabhängig von dem Fläche-zu-Kontur-Wechsel – Mühe, die Frage zu verstehen. Pfad verschieben verkleinert nix. Es verschiebt das Objekt. Verkleinern wäre über Pfad skalieren. 

"Pfad verschieben" vergrößert oder verkleinert Objekte:

Kann als Effekt bearbeitbar gelassen oder über "Aussehen umwandeln" final angewendet werden.

Mit einem neu gezeichneten Kreis funktioniert das auch, wie ich festgestellt hab. Nur mit dem vorhandenen (und den 200 anderen unterschiedlicher Größe, die alle um den selben Betrag verkleinert werden müssen) eben leider nicht. Dafür such ich eine Lösung, gern auch ohne "Pfad verschieben".

Wenn du »Pfad verschieben« als Effekt einsetzt, bleibt das ursprüngliche Objekt bestehen, sieht durch den hinzugefügten Effekt aber natürlich anders aus (zB verkleinert). Der ursprüngliche Pfad bleibt aber in der Originalgröße bestehen. 

Wenn du das Objekt jedoch über »Objekt/Pfad/Pfad verschieben« änderst, wird ein zusätzlicher, geänderter Pfad über den Originalpfad angelegt. Du bekommst so also zwei Objekte: Das Original und die (verkleinerte) Kopie. 

Hilft dir das weiter?

So wie du das beschreibst, kenne ich das eben auch. Darum wundert es mich, dass sich die Kreise so seltsam verhalten und keine verkleinerte Kopie angelegt wird, sondern der identisch große Kreis mit Outline.

Naja, wie gesagt: Wenn du den Effekt anwendest, dann bleibt ja der Originalpfad bestehen, nur das Aussehen ändert sich …

Schon klar. Nur ändert sich halt das Aussehen nicht wie es sich ändern sollte, sondern es entsteht ein Kreis mit Outline, was mir nicht weiterhilft.

Sind die Kreise eventuell nicht wirklich geschlossen?

(Vielleicht mal mit dem Pathfinder kontrollieren?)

Hab zwischenzeitlich weitergeforscht … die Kreise wurden in InDesign angelegt und als X/3-pdf exportiert, dieses in Illustrator geöffnet und weiterbearbeitet. Ergebnis unbrauchbar, siehe oben.

Ein aus der selben ID-Datei exportiertes X/4 in AI geöffnet funktioniert völlig problemlos.

Wenn man’s weiß, ist’s einfach.